Лодка была замечена двумя японскими миноносцами, под обстрелом быстро погрузилась и предприняла попытку атаковать. Однако туман и высокая скорость кораблей противника не позволили осуществить пуск торпеды.
Однако сам факт наличия в русском флоте подводных лодок послужил хорошим сдерживающим фактором для японского флота, который не стал нападать на Владивосток.
Во время Первой мировой войны «Сом» по железной дороге был перебазирован на Балтику, где подводная лодка погибла в 1916 году при столкновении с шведским пароходом.