Неизвестно, эта ли старуха сдала отряд партизан боливийской армии или нет, но рейнджеры вышли на отряд Че по наводке некой женщины, слышавшей голоса у ущелья Квебрада дель Юро.
Утром 8 октября несколько групп рейнджеров заняли позиции вдоль ущелья и в полдень один из отрядов встретил огнём партизан. Два партизана погибли, многие, в том числе и Че, были ранены. В 13:30 остатки партизанского отряда были окружены силами 650 боливийских солдат.
Пленники были связаны и отведены в деревенскую школу, представлявшую из себя простую глинобитную хижину. На вопросы допрашивавших его офицеров Че не отвечал и разговаривал только с боливийскими солдатами. Несмотря на утомление, тяжёлые ранения и жалкий вид (Че был грязен, в разорванной одежде, вместо обуви имел грубые кожаные чехлы-чуни), команданте высоко держал голову, смотрел всем прямо в глаза и единственное, о чём просил — это табак для своей трубки.
А когда один из офицеров попытался вырвать у курящего Гевары изо рта трубку в качестве сувенира, Че, несмотря на связанные руки, ударил его о стену. Другой офицер — контр-адмирал Угартече — получил от Че плевок в лицо при попытке допроса.
Утром следующего дня Че Гевара попросил о встрече с деревенской учительницей, 22-летней Хулией Кортес, которой он сказал, что антипедагогично обучать бедных школьников в таких условиях, пока государственные чиновники ездят на Мерседесах. «Вот именно поэтому мы воюем против этого», — заявил он в конце беседы.
В тот же день, 9 октября, пришёл приказ о казни Че Гевары. Приказ вызвался исполнить сержант Марио Теран, потерявших в боях с партизанами трёх товарищей. Команданте был убит девятью выстрелами в ноги, руки, грудь и горло.
Тело Че было привязано к полозьям вертолёта и доставлено в соседнее село, где его выставили напоказ прессе. После того как военный хирург ампутировал руки Гевары, офицеры боливийской армии вывезли тело в неизвестном направлении и отказались сообщить, где оно было захоронено.
Смерть Че Гевары была признана тяжёлым ударом для социалистического революционного движения в Латинской Америке и во всём мире. Местные жители начали считать Гевару святым и обращались к нему в молитвах «San Ernesto de La Higuera».
В 1997 году после двухлетних поисков братская могила Че и его товарищей была обнаружена. Одно из тел было идентифицировано как принадлежащее Геваре и возвращено на Кубу.
16 октября 1997 года останки команданте и шестерых его товарищей были перезахоронены с воинскими почестями в специально построенном мавзолее в городе Санта-Клара, где была выиграна решающая для кубинской революции битва.